Los goles de Young y Fellaini, en la primera parte, y los de Mata y Smalling tras la reanudación superaron a los dos del Kun y valieron los tres puntos para los Diablos Rojos.
Sacaron el martillo los de Van Gaal para remontar un partido que tuvo otra pinta totalmente opuesta durante los primeros diez minutos.
Y es que los citizens no empezaron nada mal, dominando el encuentro y gozando de las ocasiones más claras del partido.
Navas, a los cinco de juego, tuvo en sus botas el primero, pero De Gea aguantó bien en el mano a mano y le ganó la partida a su compatriota.
Poco después, el Kun sí acertó a remachar a la red un pase de Silva, firmando su gol número 99 desde que llegó al Etiad.
Pero el 0-1 tuvo un efecto despertador en los locales, que comenzaron a adelantar líneas y a hacerse cada vez más presentes en las inmediaciones del área de Hart.
Al cuarto de hora, Young, con algo de fortuna, hizo el empate tras embocar su propio rechace.
Las cosas acabaron de empeorar antes de la media hora cuando Fellaini ganó el segundo palo y de cabeza dio la vuelta al marcador.
No funcionaba el centro del campo del campeón de la Premier y el equipo se hizo muy largo, lo que dificultaba la conexión entre Silva y Agüero.
Antes del descanso, Kompany vio tarjeta amarilla por una entrada a Blind y Mangala le sustituyó tras el descanso.
Al inicio de la reanudación fue el momento de Joe Hart, que se lució para mantener el marcador con una doble parada a Rooney y Carrick.
Pero el castigo de los locales, ya con Nasri en el campo en lugar de Milner, no se hizo esperar mucho más.
Mata aprovechó un balón a la espalda de la defensa citizen para batir a Hart antes de que Smalling, convirtiera el cuarto tras rematar una falta lateral.
Primera derrota tras cuatro derbis para un City que se queda cuarto en la clasificación y con el objetivo de amarrar su plaza Champions de aquí a final de temporada.
Herida de las que duelen en Old Trafford pero toca cicatrizar pronto para afrontar las seis jornadas que quedan.
El próximo compromiso, el domingo ante el West Ham en el Etihad.